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生物大分子的分离--血红蛋白凝胶层析

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实验3 生物大分子的分离——血红蛋白凝胶层析

3.1 相关基础知识

凝胶层析又称凝胶排阻层析、凝胶过滤、分子筛层析和凝胶渗透层析,是一种按分子大小分离物质的层析方法,广泛应用于蛋白质、核酸、多糖等生物大分子的分离和纯化。该方法是把样品加到充满着凝胶颗粒的层析柱中,然后用缓冲液洗脱。大分子无法进入凝胶颗粒中的静止相中,只能存在于凝胶颗粒之间的流动相中,因而以较快的速度首先流出层析柱,而小分子则能自由出入凝胶颗粒中,并很快在流动相和静止相之间形成动态平衡,因此就要花费较长的时间流经柱床,从而使不同大小的分子得以分离。

凝胶层析所用的基质是具有立体网状结构、筛孔直径一致,且

呈珠状颗粒的物质。这种物质可以完全或部分排阻某些大分子化合

物于筛孔之外,而对某些小分子化合物则不能排阻,但可让其在筛

孔中自由扩散、渗透。任何一种被分离的化合物被凝胶筛孔排阻的

程度可用分配系数Kav (被分离化合物在内水和外水体积中的比例

关系)表示。Kav 值的大小与凝胶床的总体积(Vt )、外水体积(Vo )及分离物本身的洗脱体积(Ve )有关,即:

Kav= (Ve-Vo)/(Vt-Vo)

在限定的层析条件下,Vt 和Vo 都是恒定值,而Ve 值却是随着分离物分子量的变化而变化的。分离物分子量大,Kav 值小;反之,则Kav 值增大。因此,在同一凝胶柱上分离分子量不同的物质时,由于流动相的作用,这些分离物质将发生排阻和扩散效应。若缓冲液连续地倾入柱中,柱中物质的排阻和扩散效应也将连续地发生,其最终结果是分子量大的物质先从柱中流出,分子量小的物质则后从柱中流出。流出物用部分收集器分管等量或等时地收集起来,检测后分段合并相同组分的各管流出物,即等于把分子量不同的物质相互分离开了。其分离效果受操作条件(如基质的颗粒大小、均匀度、筛孔直径和床体积的大小、洗脱液的流速以及样品的种类等)的影响,而最直接的影响是Kav 值的差异性,Kav 值差异性大,分离效果好;Kav 值差异性小,则分离效果很差,或根本不能分开。

分配系数Kav 既是判断分离效果的一个参数,又是测定蛋白质分子量的一个依据。从公式Kav= (Ve-Vo)/(Vt-Vo)可知,只要测出床体积Vt 和外水体积Vo 以及洗脱体积Ve ,即可计算出Kav 值。而凝胶床总体积Vt 可用二种方法得到:

计算法:根据层析柱体积计算总体积,可用下列公式表示

Vt= πr 2h

式中r 为层析柱半径;h 为凝胶床高度;π为圆周率。在用此公式计算凝胶床总体积时,须精确地分段测量,以防内径不匀造成误差。另外还须注意到,在层析过程中,尤其是软胶的操作压力要小,以防凝胶床的高度降低。

测量法:由凝胶床的组成可知,床体积Vt 等于外水体积Vo 、内水体积Vi 与凝胶颗粒实际占有体积Vg 之和。即

Vt= V0+Vi+Vg

因Vg 与Vt 相比很小,可忽略不计,故

Vt= V0+Vi

而Vo 和Vi 可通过实验测得:当把分子量不同

的混合溶液铺在凝胶床上时,其在内水体积和外水

体积中的分布是不一样的。溶液中的分子大于凝胶孔径上限者不能进入凝胶网孔内,而被排阻在外水体积的溶液中。凝胶床的洗脱体积Ve 刚好等于外水体积。即Ve=Vo (Kav=0)。然而,溶液中的分子小于凝胶孔径下限者能自由进入凝胶网孔内,凝胶床的洗脱体积Ve 应等于凝胶床总体积,即Ve= Vt= Vo+Vi (Kav=1)。而溶液中的分子大小介于凝胶孔径上限和下限之间者,则能进入部分凝胶网孔中,故其洗脱体积Ve 是在Vo 和Vt 之间(Kav 在0-1之间)。

通常选用蓝色葡聚糖2000作为测定外水体积的物质。该物质分子量大(为200万),呈蓝色,它在各种型号的葡聚糖凝胶中都被完全排阻,并可借助其本身颜色,采用肉眼或分光光度仪检测(210nm 或260nm 或620nm )洗脱体积(即Vo )。但是,在测定激酶等蛋白质的分子量时,不宜用蓝色葡聚糖2000测定外水体积,因为它对激酶有吸附作用,所以有时用巨球蛋白代替。测定内水体积(Vi )的物质,可选用硫酸铵、N-

乙酰酪氨酸乙酯,或者

其它与凝胶无吸附力的小分子物质。

以床体积Vt (等于 r 2h )和测得值Vo 来计算分配系数的值为Kav ,若以床体积Vt (等于Vo+Vi)和测得值Vo 来计算分配系数的值为Kd 。在同一层析条件下,对同一物质计算出来的Kav 和Kd 值尽管有一定的差异性,但都是有效的。只因Kav 计算方便,所以目前多使用Kav 。分离物在凝胶过滤层析时的行为,除用Kav 和Kd 表示外,还可用Ve/Vo或Vo/Ve(R 值)表示。

凝胶过滤不仅常用做物质的分离,还可以根据需要用某种试剂非常方便地处理某种物质,当该物质流经试剂区时,因为可连续接触新鲜试剂,因而可以充分发生反应,最后经过洗脱,再与过量的试剂分开。本实验就是通过凝胶过滤,用还原剂FeSO 4处理血红蛋白。即首先在层析柱中加入含有还原剂的溶液,使形成一个还原区带,当血红蛋白样品(血红蛋白与铁氰化钾的混合液)流经还原区带时,褐色的高铁血红蛋白立即生成紫色的还原型血红蛋白,随着还原型血红蛋白继续下移,与缓冲液中的氧分子结合又形成了鲜红的血红蛋白。铁氰化钾则因分子量小,在层析柱中呈现其本来的黄色带而远远地落在血红蛋白的后边。

本实验操作简便,直观性强,趣味性浓,通过肉眼观察即可检验分离效果。

3.2 实验目的和要求

(1)

(2)

(3)

(4) 了解生物化学领域中大分子分离纯化的各种方法。 了解凝胶层析的原理以及应用。 通过血红蛋白脱盐实验,初步掌握凝胶层析技术。 进一步掌握包括离子交换柱层析、亲和层析及吸附层析等其它分离纯化的方法。

3.3 实验材料和器材

3.3.1 实验器材

(1) 层析柱:Ø10mm×20cm;

(2) 恒流泵;

(3) 500ml ,250ml 试剂瓶;

(4) 50ml 烧杯;

(5) 其它:医用镊子;5ml 带刻度滴管;圆片滤纸。

3.3.2 实验材料与试剂

(1) 20mM 磷酸二氢钠;

(2) 20mM 磷酸氢二钠;

(3) pH7.0,20mM 磷酸缓冲液:将(1)、(2)以61:29的比例混和;

(4) 40mM FeSO4(用时现配) ;

(5) 0.2M Na2HPO 4,80mM Na2H 2EDTA ;

(6) 抗凝血(哺乳动物血样,以1:6的比例加入2.5%柠檬酸钠,置于4℃冰箱中保存。

贮存期以不超过3个月为宜);

(7) 葡聚糖凝胶:Sephadex G-25;

(8) 固体铁氰化钾。

3.4 实验方法与步骤

3.4.1 葡聚糖凝胶的预处理

取3克葡聚糖凝胶(Sephadex-25)干粉,浸泡于50ml 蒸馏水中充分溶胀(室温,12h ),然后反复倾斜除去表面的悬浮微粒,再加入pH7.0磷酸缓冲液沸水浴中2-3h 去除颗粒内部空气,最后加入pH7.0磷酸缓冲液浸泡过夜备用。

3.4.2 装柱

(1) 将层析柱垂直固定在铁架台上,注意上下不要颠倒;

(2) 将层析柱下端的止水螺丝旋紧,向柱中加入约1-2cm 高的缓冲液,把溶胀好的糊状

凝胶边搅拌边倒入柱中,最好一次连续装完,若分次装入,需用玻璃棒轻轻搅动柱

床上层凝胶,以免出现界面。装柱长度至少8cm 。自然沉降20min ,最后放入略小于层析柱内径的圆形滤纸片,以防将来加样时凝胶被冲起。

3.4.3 平衡

以恒流泵控制流速为1滴/5秒,用磷酸缓冲液洗脱平衡10min 。注意在任何时候不要使液面低于凝胶表面,否则可能有气泡混入,影响液体在柱内的流动与最终生物大分子物质的分离效果。

3.4.3 血红蛋白样品的制备

取1ml 抗凝血于烧杯中,加入10ml pH7.0 20mM磷酸缓冲液,再加入固体铁氰化钾,使浓度达到5mg/ml。

3.4.5 层析柱还原层的形成

取1ml 40mMFeSO4于小烧杯中,加入1ml 0.2M Na2HPO 4,80mM Na2H 2EDTA 混合液搅拌均匀。待层析柱上缓冲液几乎全部进入凝胶时,速取该混合液0.4ml 加入层析柱中,待混合液完全进入柱床后加入0.7ml 缓冲液。(注意还原剂的混合液要新鲜配制,尽可能缩短在空气中暴露的时间)。

3.4.6 上样

将柱中多余的液体从底部流出后关闭止水螺丝, 取前面制备好的血红蛋白样品0.5ml ,将样品溶液小心加到凝胶柱上,打开止水螺丝,使样品溶液流入柱内。

3.4.7 洗脱

用缓冲液进行洗脱,控制缓冲液在约1滴/5秒的流速,观察并记录实验现象。

3.4.8 清洗

待所有色带流出层析柱后,加快流速,继续清洗层析柱2min 。回收凝胶,以备再用。

3.5 问题讨论

(1) 在向凝胶柱加入样品时,为什么必须保持胶面平整?上样体积为什么不能太大?

(2) 请解释为什么在洗脱样品时,流速不能太快或者太慢?

(3) 某样品中含有1 mg A蛋白(Mr 10,000Da),1 mg B蛋白(Mr 30,000Da),4 mg C蛋

白(Mr 60,000Da),1 mg D蛋白(Mr 90,000Da),1 mg E蛋白(Mr 120,000Da),采用Sephadex G75(排阻上下限为3,000 -70,000Da )凝胶柱层析,请指出各蛋白的洗脱顺序。

3.6.1 实验名称

3.6.2 实验日期

3.6.3 学生姓名

3.6.4 指导老师

3.6.5 实验现象记录

3.6 实验记录和报告


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