生物技术通报
・综述与专论・
BloTEcHNoLoGY
BULLETIN
2009年第9期
青霉素酰化酶表达调控的研究进展
蒋咏梅1
章文贤1
魏东芝2
(1福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心福建师范大学生命科学学院福建省现代发酵技术工程研究中心,福州350108;
2华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室鲁华生物技术研究所,上海200237)
摘要:青霉素酰化酶(penicillinacylase,PAC)是抗生素工业的重要酶。它在大肠杆茵中需经过复杂的转录、翻译和后翻译才能成熟,且后翻译过程对活性酶的最终形成影响很大。在阐述PAC的苯乙酸诱导机制的基础上,详细论述了PAC的后翻译过程,并对几种主要的影响因素进行了分析。
关键词:青霉素酰化酶大肠杆菌诱导机制后翻译过程影响因素
StudiesofRegulatingofExpressionofRecombinationPenicllinAcylase
JiangYongmeil
Zhang
WenxianlWei
Dongzhi2
University;
(‘EngineeringResearchCenterofIndustrialMicrobiology,MinistryofEducation,CollegeofLifeSciences,FujianNormal
EngineeringResearchCenterofFujianModemFermentationTechnology,Fuzhou350108;2State
Bioreactor
Engineering,East
KeyLaboratory
of
China
University
ofScienceandTechnology,Shanghai200237)
Abstract:Penicillininvolves
acylase(PAC)is
an
importantenzymeofantibioticsindustrial.FormationofmaturePACinEscherichiacoli
step
transcription,translationandposttranslational
process
whichisthekeyprocess.This
paper
reviewedthemechanismofPACin—
duction,posttranslational
andmaininfluencingfactorsof
Escherichiacoli
formation
ofactivePAC.
Posttranslational
step
Keywords:Penicillinacylase
Mechanism
ofinductionEffectfactor
青霉素酰化酶(E.C.3.5.1.11)自1950年首次在黄青霉(Penicilnumchysogenum)Q176中发现以来,就以其良好的催化酰化/去酰化特性受到了广泛关注。PAC不仅能催化6.APA、7-ADCA与侧链化合物缩合生成各种高效低毒的半合成抗生素,还可应用于许多有潜在价值的反应中,如在肽的合成过程中用于保护氨基和羟基,以及用于手性化合物的拆分等…。
产生青霉素酰化酶的微生物很多,可分为革兰氏阴性菌(G。)和革兰氏阳性菌(G+)两大类,前者有大肠杆菌(Escherichia
coliATCC
Ax)等;后者有巨大芽孢杆菌(Bacillus
ATCCATCC
megaterium
14954,Bm)与粘节杆菌(Arthrobacter口括c∞淞15294,Av)等。G。菌产生的PAC通常定位于
周质空间,G+菌产生的青霉素酰化酶则分泌于胞外。
目前研究最多的是大肠杆菌来源的青霉素酰化酶,它定位于周质空间,由仅(24kD)和B(65kD)两个亚基组成。pac基因首先转录表达产生前体PAC,再经复杂的后翻译形成有活性的成熟酶。该过程与哺乳动物中的激素形成相似,这在细菌中极为罕见。
11105。Ec),嗜柠
檬酸克鲁沃尔氏菌(KluyveracitrophilaATCC21285,
rettgeriATCC
1青霉素酰化酶基因的表达调控
大肠杆菌中,pac的转录效率通常很低,将pac基因置于强启动子的控制下,并在核糖体结合位点和起始密码子之间插入一段间隔序列能够分别提高
Kc),雷氏普罗威登斯菌(Providencia
31052,Vr),粪产碱杆菌(Alcaligenesfaecalis,Af)与无色杆菌木糖氧化属(Achromobacter
xylosoxidans,
收稿日期:2009—05・20
基金项目:上海市重点学科建设项目(B505)
作者简介:蒋咏梅(1971・),博士,研究方向:生物化工;E-mail:ymjiansbio@qnu.edu.Cll
通讯作者:魏东芝(1963-),男,教授,博士生导师,研究方向:生物催化工程和生物制药工程;E・mail:dzhwei@eCUSt.edu.cn
万方数据
2009年第9期蒋咏梅等:青霉素酰化酶表达调控的研究进展
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转录和翻译效率,并最终提高PAC产量,但过表达的酶无活性且发现了包涵体的聚集嵋一。
对青霉素酰化酶在大肠杆菌中的表达研究发现,主要存在3种调控机制:分解代谢阻遏、PAA诱导,温度调节。在野生型大肠杆菌中,PAC的表达受碳源的调节,有些碳源如甘油、乳糖、果糖和葡萄糖对pac基因的表达有代谢抑制作用,而苯乙酸作为惟一碳源对pac基因转录有诱导作用,这些底物是在转录水平上影响pac基因的表达"o。尼citro—phila中PAC的合成也存在类似情况。在P.rettgeri中则恰恰相反,PAC的表达既不受PAA诱导也不受
葡萄糖的抑制,但TCA循环中的琥珀酸,延胡索酸,
苹果酸却能够抑制PAC的表达Ho。A.faecalis,A.t,i¥CO¥1t和B.Megaterium中的PAC表达同样受PAA诱导,但不受分解代谢阻遏抑制。PAC表达的温度调控则广泛存在于上述菌株中。
2004年Kim等¨1对PAA的诱导机制进行了研究,发现在E.coliW
ATCC
11105中,PaaX是pac基
因表达的阻遏物,PAA的真正作用是将pac基因从PaaX的阻遏中解脱出来,具体机制如图1所示。
A—逗重≥恒国————臣卜匦卜1∞
B
C
A.pac启动子;B.正常生活状态下PaaX阻遏pac表达;C.PAA的去阻遏作用
图1
pae基因调控模型‘51
在大肠杆菌pac的启动中,PaaX和cAMP—CRP复合物竞争性地与CRP结合位点I相结合,因而它们的存在对pac的表达产生相反的作用。在PAA不存在时的正常生长状况,PaaX结合于pac操纵子
万方数据
上的结合位点,由于该位点与CRP的结合位点相交叠,导致cAMP—CRP复合物无法与CRP位点结合,因此PAC不能表达(图1)。当培养基中存在PAA时,它进入细胞核质内被PaaK催化形成PAA—CoA复合物,进而阻止PaaX之间的相互作用,使PaaX无法与pac操纵子相结合。而cAMP—CRP复合物在与高亲合性的CRP结合位点Ⅱ结合后,便可以与空闲的CRP结合位点I结合,继而启动pac的转录。
2青霉素酰化酶的后翻译过程
大肠杆菌中,形成活性PAC的过程较为复杂,首先经转录和翻译形成带有信号肽,间隔肽,仅和B亚基的前蛋白酶原(ppPAC,95kD),后翻译过程包括:(1)在信号肽的引导和分子伴侣的帮助下,pp—PAC转运至周质空间,通过质膜的同时,26个氨基酸的信号肽被蛋白酶水解除去形成酶原(pPAC,91kD);(2)从13亚基的N端切除连接肽产生13亚基(557个氨基酸,65kD);(3)a亚基进一步通过分子内或分子间的自催化作用从C端水解,同时54个氨基酸的间隔肽被切除(209个氨基酸,24kD)L61,最终产生由209个氨基酸的Ot亚基和557个氨基酸的13亚基折叠成的活性酶。青霉素酰化酶基因表达及其后加工过程见图2。
gene
5,,,==CRP5’:=]3’
CRP-35-10
structural33,
葡蒜嚣刘.RBS转录pac
-,,———一.。—’~mRNA
1.翻译
巧aj[=]j匕][=][=j
I
p∞pmPAC
信号肽移除l转运
进入周质空间J
-
‘I。。。‘。。‘。‘a‘’。。。。。。I’。。‘‘(‘.。。。。‘。。。i’‘。‘。。‘。‘‘。‘‘。’8。‘‘。‘。。’‘。‘‘。‘。‘I
pmPAC
连鬻除l加工
亡互=]匕==匿==]PAC
S.信号肽;ct.n亚基;c.连接肽;B.B亚基
圈2大肠杆菌中PAC的表达及成熟过程‘71
成熟的青霉素酰化酶是由仅亚基和13亚基组
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生物技术通报Biotechnology
Bulletin
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成的,但这两个亚基在单独存在时均无活性,将它们的基因分别构建在不同的质粒上,放入同一个宿主中表达时,细胞质中的酶活则可恢复至野生菌株的水平。此外,间隔肽对酶活的影响也很大,在ot亚基与p亚基之间加上一个长度为54个氨基酸的间隔肽时,活力明显降低。
由图2可见,青霉素酰化酶表达的基因调控过程很复杂,影响因素也较多。为得到高产量的活性青霉素酰化酶,除了从转录和转译水平促进PAC的表达外,还需要提高后翻译的效率。Ignatova¨1通过在培养基中加入氯霉素阻止蛋白质继续合成,研究后翻译水平对PAC产量的影响,发现PAC的成熟过程中,限制其产量的关键步骤包括蛋白酶水解,通过质膜的转运过程和分子伴侣介导的蛋白重折叠。
3影响后翻译过程的因素
3.1蛋白酶水解
大肠杆菌中,外源蛋白在细胞内的过表达常常引起一系列生理反应,如中间代谢和调节功能的改变,细胞生长停滞,核糖体破坏和细胞死亡等,给宿主本身带来严重的生理负担归1。因此,细胞的胞质内,周质空间和质膜上有大量内肽酶用于水解外源蛋白,水解后的肽链则继续被肽末端降解酶消化。研究表明,胞内超过90%已合成的PAC前体被胞内蛋白降解¨o。为减少PAC的降解,可采用某些特定的方法,如使用蛋白酶缺陷菌株,低温培养宿主菌,共表达分子伴侣,调整发酵条件,降低细胞生长速率,改变蛋白质特定的氨基酸残基以消除蛋白酶切位点等。3.2通过质膜的过程
外源蛋白在胞质内合成后,可能定位于不同的细胞部位,如周质空间,细胞外膜,甚至胞外的培养基中¨…。周质空间为氧化状态,其中存在利于含二硫键蛋白正确折叠的酶,且细胞的大多数自身蛋白聚集于胞内,因而外源蛋白定位于周质空间对后期的提取更为有利,这就需要正确的信号肽来引导蛋白通过合适的转运系统跨越质膜。
3.2.1
信号肽的影响信号肽在PAC前体肽的跨
膜转运过程中起着极其重要的作用,它可协助完整的前体蛋白转移到周质空间,信号肽的切除则是PAC在大肠杆菌中表达加工过程的关键步骤,发生在前体蛋白穿过原生质膜的过程中。移除信号肽的
万方数据
突变株虽然可以完成部分后翻译过程,但PAC活性明显下降,无活性的前体肽积累在胞浆中,且间隔肽未被加工切除…1。有人曾通过设计引导肽的序列使蛋白前体顺利通过质膜¨21。采用疏水性的信号肽可带动ppPCA从胞浆内转运到周质空间,提高青霉素酰化酶的分泌和折叠能力。Monroy¨刮对大肠杆菌的信号肽基因序列的Lys2一Thrl3(N端)和Alal4一Leu25(C端)进行随机诱变,发现有几个信号肽突变株的分泌表达水平比野生型提高了4倍。3.2.2转运系统
大肠杆菌中大多数蛋白都是通
过Sec系统转运的。其中,SecB是帮助转运胞外蛋白和周质空间蛋白分泌的重要组分,缺失SecB的突变株则失去了生产活性PAC的能力,这种缺陷可通过染色体外的SecB共表达得以恢复。但是,过表达SecB并不能提高活性PAC的产量,只能减少胞内包涵体的形成,说明SecB的主要作用在于有效地转运ppPAC进入周质空间¨“。
最近发现的双精氨基酸转运系统(Tat)能够转运Sec不能转运的蛋白。识别序列为SRRXFLK,其中含有两个精氨酸残基¨引。大肠杆菌ppPAC的信号肽虽然只含有被天冬氨酸分隔开的两个精氨酸残基,但在研究E.coliJARVl5的Tat突变体发现,ppPAC的信号肽也能有效地通过Tat转运。而且,两个精氨酸中间天冬氨酸缺失或被Lys置换也不会对Tat转运造成影响。但是如果将第二个精氨酸转变成丝氨酸,则Tat转运系统失效,ppPAC转而进入Sec转运系统¨61。将ppPAC原来的信号肽转换成依赖SecB的OmpT信号肽,随着SecB的过表达,仍然发现pPAC成功地转运至周质空间中Ⅲ’。
3.2.3
辅因子的影响酶的辅因子为酶的生物学
活性或成熟所必须的离子或分子。这些金属离子不直接参与酶的功能,但对于成熟,活性和酶的稳定性很重要。成熟EcPAC的晶体结构中观察到每个酶分子都与一个钙离子紧密结合¨引。来源于E.coli,P.rettgeri,A.faecalis,A.viscosus和K.citrophila的青霉素酰化酶¨9’驯中也同样发现了钙离子的踪迹。钙被PAC分子包埋在内部深处,说明它的结合优先于转运的发生。
钙离子是ppPAC的膜转运、正确折叠和成熟所必需的辅因子,因此活性PAC的产量就部分依赖于
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培养基中的钙离子浓度。当培养基中钙离子浓度增加到60—750p.M时,E.coilBL21(DE3)中AfPAC和EcPAC的产量增加了两个数量级旧“。分别通过Tat系统和See系统转运的EcppPAC和AfPAC,均发现钙缺乏时前体肽在胞质内的积累。E
coliBL21
(DE3)中表达EcPAC时,培养基中钙离子浓度增加到100mM可使产量提高3倍,PAC从胞内向周质空间的转运能力也得到大幅提高mJ。3.3蛋白的重折叠
青霉素酰化酶的前体酶原(ppPAC)去除信号肽进入周质空间后,还需要分子伴侣切除空间肽才能折叠成有活性的PAC。分子伴侣通常分为两种,一种是转运系统中的组分蛋白,如SecB;另一种通常是些热休克蛋白,如GroEl和DnaK。自从发现周质空间也存在包涵体以来,周质空间内的蛋白折叠同样成为一个普遍的问题旧]。过表达分子伴侣提高周质蛋白产量的策略被广泛应用。ChouⅢ1发现,胞质和周质空间都有成熟的PAC,说明后翻译过程同时存在于胞质和周质空间。还通过共表达分子伴侣trigger因子,GroEL/ES和DnaK/J—GrpE,增加了PGA成熟限制性DegP是同时具有蛋白酶活性和分子伴侣活性的热休克蛋白,为大肠杆菌细胞外膜蛋白水解所必须。DegP在周质空间的共表达可防止前体PAC在周质空间的错误折叠,明显减少了包涵体量,但该策略对胞内PAC前体的累积没有效果汹,261。当共表达缺失蛋白酶活性而保留分子伴侣活性的DegP
时,PAC活性没有增加,说明DegP的蛋白酶活性是的蛋白需要它来降解。但是,周质空间蛋白酶的缺失并非形成包涵体的主要原因,因为共表达与DegP相似的周质空间蛋白酶DegS或DegQ也同样无法
提高PAC的活性,说明DegP的分子伴侣活性和蛋白酶活性都是PAC成熟过程所必须的B“。
青霉素酰化酶的表达包括转录、转译及复杂的后翻译过程。细胞中,首先形成的是PAC的前体多肽,万方数据
可能成为产生活性青霉素酰化酶的瓶颈。因此,在PAC的表达中,仅仅提高pac基因的转录和翻译效率,提高蛋白表达量远远不够。只有通过调控菌体生长的代谢过程和环境中的诸多因素,维持一个从转录,翻译到后翻译过程的蛋白合成流,才能最大限度减少包涵体的形成,提高活性PAC的产量。
参考文献
lShewaleJD.eta1.ProcessBiochemistry,1990,25:97—103.
2Chou
CP。eta1.Biomehnolo
and
Bioengi,1999,63(3):263—72.
3
MerinoE,et
a1.Molecular
Microbiology。1992,6(15):2175
_2182.
4DaumyGO,et
a1.J
Bacteriol,1982,152(1):104—110.
5KimHS,eta1.J
Biol
Chemi,2004。279(32):33253—33262.
6
ChouCP,et
a1.Enzyme
MiembTechnol,2000,27(10):766
—773.
7
RajendhranJ,GunasekaranP.RJournalofBioscieneeandBioengi—
neering,2004,97(1):l—13.
8
Ignatovaz,eta1.Enzyme
Microb
Teehnol,2000,26(2):165
—170.
9Oh
MK,LianJC.MetabolicEngineering,2000,2(3):201—209.
10
Geo晒ⅧG,et81.CurtOpin
Biotechnol,2005,16(5):538-45.
“ChoiKS,et矗1.J
Baeter/ol,1992,174(19):6270~6276.
12LeeSY,eta1.Trendsin
Biotechnology,2003,21(1):45—52.
13
Monroy-La9080,eta1.Appl
Environ
Mierobiol,2006,72(5):
3797—3801.
14Chou
CP。eta1.Bioteehnology
Progress,1999,15(3):439-445.
15BerksBC.Molecular
Microbiology,1996,22(3):393~404.
16
Ignatovaz,eta1.BiochemBiophysi
Bes
Commun,2002,291(1):
146~149.
17
IgnatovaZ,MahsunahA,GeergievaM,et
aI.AppliedandEnvi—
ronmental
Microbiology,2003,69(2):1237—1245.
18
HewittL。KascheV。Lumnler
K,et
a1.Journal
ofMolecularBiolO-
gY,2000,302(4):887—898.
19KaseheV,GalunskyB,IgnatovaZ.EuropeanJournal
ofBiochemis・
try,2003,270:4721—4728.20Kasehe
V,lgnatova
Z,MarklH,eta1.BioteehnologyProgress,
2005,21(2):432~438.
21
Kasehe
V,Haufler
U,MarkowskyD,eta1.AnnalsoftheNewYork
AcademyofSciences,1987,501:97一102.
22JiangYM。et
al,Bioteehnoi
Prog,2007,23,1031—1037.
23Baneyx
F,MlljacicM.Nature
Bioteehnology,2004。22(11):1399—1408.24XuY,eta1.ApplEnvironMicrobiol,2005,71(10):6247~6253.
25LinYH,et
a1.ProcessBiochemistry。2001。37(1):23—30.
26Pan
KL,et
a1.J
Bacteriol,2003,185(10):3020一3030.
27
BothmannH,eta1.Nature
Biotechnology,1998,16(4):376—380.
步骤的效率,其中trigger因子效果最为明显。
促进折叠的主要因素,可能pac过表达时错误折叠4总结
包括引导肽,连接肽和a,B亚基,在跨越质膜进入周质空间的过程中去除引导肽和连接肽,再经重新折叠才能形成有活性的PAC。该过程中的任何步骤都有