首先，多媒体教学不利于发挥学生的想象。由于多媒体教学课件是由教师事先设计的，对教学过程、教学内容甚至问题的设计都早已安排好，上课时，教师只是按照准备好的流程机械地操作鼠标，完成各个教学步骤。也就是说，教师划定了一个由起点到终点的严密轨迹，千方百计地引导学生沿着课件指示的轨迹走下去，不敢越雷池半步，没有灵活的在课堂上修改补充一些课件中的不足的机会。同时，有些课件在化抽象为形象的同时，使学生失去了通过语言文字来进行形象再创造的机会，也就使学生失去了提高对语言文字感悟能力的机会，从而不利于学生品味语言，运用语言能力的提高。还有些课件在制作时过多的运用动画，忽视了它对学生注意力产生的的负面影响。
其次，多媒体教学不利于课堂师生情感的交流。大量色彩鲜明的图片和优美动听的音乐的介入，吸引了学生的注意力，影响了课堂效果，也降低了课堂效率。多媒体的应用使板书相对减少，师生忙与应付眼花缭乱的课件，学生忙于看屏幕上的知识，没有思考的间隙，而教师也将目光移向课件，很难即时了解学生对所学知识的反馈，阻碍了师生情感的交流。课堂由原来的被教师把持着、控制着，到现在的完全被多媒体课件控制着，不能不说是由一个极端走向了另一个极端。其实，教学不应该是教师的一言堂，而是师生互动的双向配合；教师也不应该只是多媒体的一个操纵者，而应是师生情感交流的调控者。
另外，多媒体教学手段扼杀了课堂的生动性。表面上看，运用多媒体辅助教学能充分调动学生各种感官的功能，激发学生学习的热情和强烈的求知欲望。事实上，多媒体教学的格式化、定义化、程序化，使整个课堂只能按照教师事先设计的程序按部就班地进行，每堂课也是由教师分割成若干支离破碎的板块作定式的学习，学生只能被动接受。
还有，多媒体教学课件的制作需花费教师大量时间。多媒体教学课件的制作需花费大量的时间，容易使教师放松对于教材教法的研究。多媒体教学的种种功能设置，是一项非常繁琐的工作，教师为了使画面漂亮些，文字富于变化些，往往在一项设置上需反复设置、反复运行演示，需要花费大量的时间，对于课件的设计付出太多，教师往往就无力再去钻研教材教法了。多媒体教学的实施，要考虑学科的张力和可创造性，不能只停留在媒体本身的优化组合上，与正确的现代化教学观念脱节，要从学科的实际出发，正确对待多媒体，发挥其更有效的作用。
由于网络媒体的出现和多媒体技术的迅速发展使得传统教育方式发生了重大变革，学习者能够在智能化、多媒体化、网络化的环境中学习。一时间，利用网络多媒体教授和学习成为教学改革追逐的热点，传统的教学媒体似乎正处于被冷落、被遗忘的境地。有人甚至认为，计算机网络媒体的教学功能优于所有其它种类的媒体，因而，仅单一开发使用这种媒体就可以实现教学的最优化，而其它传统媒体都过时了。其实，媒体在教学中的有效性并非与技术的先进性成正比。计算机网络等高科技媒体有着其特有的其它媒体不能取代的功能，但这决不意味着普通媒体能够很好的实现的功能，统统都要用高科技媒体取代。事实上，媒体对各类知识的表现力是不同的。每种教学媒体在传授知识、培养技能和开发智力等方面都有自己的特点和长处。所以，并不存在一种能解决一切教育难题的万能媒体。