增值税对小规模纳税人采用简易征收办法，对小规模纳税人适用的税率称为征收率。
考虑到小规模纳税人经营规模小，且会计核算不健全，难以按增值税税率计税和使用增值税专用抵扣进项税额，因此实行按销售额与征收率计算应纳税额的建议办法。自2009年1月1日起，小规模纳税人增值税征收率由过去的6%和4%一律调整为3%，不再设置工业和商业两档征收率。征收率的调整，由国务院决定。
按简易办法征收增值税的纳税人，增值税的征收率为2%、3%、4%或6%。
小规模纳税人(除其他个人外)销售自己使用过的固定资产，减按2%征收率征收增值税。只能够开具普通发票，不得由税务机关代开增值税专用发票。
小规模纳税人销售货物或者应税劳务，实行按照销售额和征收率计算应纳税额的简易办法，并不得抵扣进项税额。其应纳税额计算方式为：
应纳税额=销售额×征收率
由于小规模纳税人在销售货物或应税劳务时，一般只能开具普通发票，取得的销售收入均为含税销售额。所以在计算应纳税额时，必须将含税销售额换算为不含税的销售额后才能计算应纳税额。
小规模纳税人销售货物或应税劳务采用销售额和应纳税额合并定价方法的，按下列公式计算销售额：
销售额=含税销售额/(1+征收率)
征收方式
小规模纳税人主要有三种征收方式：查账征收、查定征收和定期定额征收。
查账征收：税务机关按照纳税人提供的账表所反映的经营情况，依照适用税率计算缴纳税款的方式。这种方式一般适用于财务会计制度较为健全，能够认真履行纳税义务的纳税单位。
查定征收：税务机关根据纳税人的从业人员、生产设备、采用原材料等因素，对其产制的应税产品查定核定产量、销售额并据以征收税款的方式。这种方式一般适用于账册不够健全，但是能够控制原材料或进销货的纳税单位。
定期定额征收：税务机关通过典型调查、逐户确定营业额和所得额并据以征税的方式。这种方式一般适用于无完整考核依据的小型纳税单位。