基于匠疗大数据的蝠床科研军合应用设计
俞高①
摘要
目的:医院信息平台建设为医院汇集海量的临床诊疗数据,这些数据的应用有待于进一步挖掘,以便为医院构建一
套从表单制作到统计分析报告的科研分析平台,为上海市儿童医院医护人员进行科学研究提供辅助支持。方法:基于医院临床数据中心,构建具有儿科特色的专病数据集市,集成统计分析工具建设临床科研产品。结果:实现医院HIS、RIS、LIS等医疗信息系统间的各类科研数据共享,建成科研病历检索、专病诊断视图、科研数据管理及随访系统,解决医院科研人员对数据处理的难题。结论:降低了医护工作人员进行医学科研工作的门槛,提升了医院科研成果产出。关键词大数据科研平台
统计分析
Doi:lO.3969/j.issn.1673—7571.2016.09.005【中图分类号】R一012
【文献标识码】A
TheApplicationandDesignoftheClinicalScientificResearchPlatformBased
on
theMedicalBigData/YUGao//ChinaDigital
Medicine.一2016
Abstract
1
1(9):15
tO
17
Objective:The
tO
hospital
informationplatform
objective
hascollectedamountsofclinical
tO
diagnosisandtreatmentdata,theapphcation
ofthesedataisbefurthermined.The
ofthispaperis
build
a
research
platformformakingclinicalresearch
form
and
analysisreport,andprovideauxiliarysupportforscientificresearchforthehospitalmedicalstaff.Methods:Byconstructingdatamartswithspecialdiseasecharacteristicsofpediatricbased
on
clinicaldatacenter,buildingclinicalresearchproductswithstatisticalanalysis
tools.Results:AchievedthescientificdatasharingamongHIS,RIS,LISandother
information
systems,andbuiltresearchrecords
retrievalsystem,diseasediagnosisviewsystem,datamanagementsystemandfollow—upsystem,solveddataprocessingproblem.Conclusion:ReducedthethresholdformedicalstaffKeywords
bigdata,research
tO
workinmedicalresearch,increasedthehospitalresearchoutput.
platform,statistical
analysis
CorrespondingauthorWinningHealthTechnologyGroupCo.,Ltd.,Hefei230000,AnhuiProvince,p.R.C.
医学领域的科学研究基本是建立在基于试验设计的研究方法上进行,这要求医学科研人员花费大量时间进行实验、控制实验条件、记录实验数据,进而分析实验数据,得出研究结果。随着医院信息平台的发展,医院逐步积累了海量以患者为核心的I临床诊疗数据,为医院和医生开展针对患者就诊的大数据科学研究提供了基础,也将进一步促进转化医学的发展…。同时,政府鼓励健康医疗大数据发展,推进医疗临床和科研大数据应用。在此背景下,上海市儿童医院遵循国家医改总体部署,结合本市公立医院改革和卫生信息化项目的需求和发展,从本院实际出发,以儿童专科为特色,搭建医疗大数据平台,促进医院临床科研方式的改变。
1科研需求
上海市儿童医院经过多年持续投入,已建立了比较完备的临床基础系统,实现对病人诊疗全过程的信息化管理,以及对院内业务信息化的全覆盖;系统间互联互通和信息共享基本实现,建立了一个平台(集成平台)、两个中心(临床数据中心、运营管理数据中心),对沉积多年的临床数据进行了收集整理,为医院进一步利用好临床数据,服务q:fl缶床科研打
①卫宁健康科技集团股份有限公司,230000,安徽省合肥市长江dP路319号
?本唾墩掌瑟攀一201
G年霹j
1吝第9期-t5
万方数据
下坚实基础。
当前上海市儿童医院的科研工作尚处在人工整理阶段,没有统一的科研管理工具。科研工作人员从业务系统通过导出Excel文件等方式获取医疗数据,再导入统计软件进行科研分析。此种方法效率较低,且手工录入易出错。由于病人诊疗数据分散在各业务系统中,当需要从某病种的多个指标维度对病例进行分析时,工作人员要从不同业务系统分别导出数据文件。这些数据文件很难按照一致的指标统一到一起。因此科研数据分析和整理的效率很低,数据不一致也限制了科研数据发挥效用。
此外上海市儿童医院的大多数专科疾病存在治疗时限长的问题,需要长期跟踪病人治疗情况,对历史病历进行查找,对历史数据进行对比。且参与的学科多,对病历的归纳要求高,容易出现遗漏病例情况。临床实验多,科研所需数据收集难;疾病个体差异大,需要更加关注个体化治疗。医院现有的人工整理手段无法满足科研管理需求,无论是病历查找、归档,还是科研数据收集、个体化治疗均存在一定难度。
次数据加工处理构建具有儿科特色的科研平台。
为解决医院内部信息系统孤立、数据复杂、信息重复、院内科研数据难以提取等问题,首先搭建医院信息平台和临床数据中心。临床数据中心的数据是基于HL7
V3
平台拥有丰富的数据接口,与SPSS、SAS、R等软件无缝连接,返回规范的数据集,这样医护人员就可使用自己熟悉的统计软件进行科学研究。
医院科研平台分为应用层、数据集市层、指标库层、临床数据中心层和业务系统层共五个层次,具体架构
见图1。
RIM/RMIM模型
和电子病历格式相关标准组织的m1,
2设计思路
缺乏统一规划的科研平台是医院科研发展现状比1,上海市儿童医院同样面临这种问题。目前建设院级科研平台的主要尝试有针对个体诊疗的中医临床实践和针对具体单病种的临床科研信息平台1:3-41。根据采用的技术分类可以分为基于云计算的互联网信息收集平台∞1和基于传统技术的科研项目管理平台。上海市儿童医院构建科研平台的方式是在医院信息集成平台和临床数据中心基础上,通过特异化的二
在不妨碍医院现有信息系统运行的前提下,利用ETL等技术将医院“信息孤岛”中的数据通过抽取、转换、加载到格式统一的数据中心,进而对数据中心中的数据进行相应加工就可得到符合相关实验规范的数据格式。对已建设完备院内数据中心的医院,可在临床数据中心的基础上,搭建符合科研课题研究目的的主题科研平台。科研平台囊括医院、科室或病种科研的各种指标,可为科研工作人员提供简洁、规范的二维表单。此外,科研
业务系统层是科研平台的数据产生来源,包括HlS、ClS、NIS、EMR、PACS及LlS等,产生的数据内容包括患者各类诊疗信息,如病史信
息、临床诊断信息、检验检查信息、
护理信息、用药信息等。
业务系统产生的数据经过采集、筛选、转换和结构化后,存储到临床数据中心层。临床数据中心层用于整个平台各类数据的处理、存储和管理,包含患者所有重要的临床数据,实现所有临床诊疗数据的整合与集中
16・China万方数据
DiqitalMedicine、Eec201
6,Vol”No
9
展现,且数据可方便的进行加工和整理,为医疗决策、科研等活动提供支持信息。
专病指标库由各种单病种数据数据库构成H1。医院科研人员根据不同指标组合检索所需的科研数据。目前,医院已将科室常用的科研统计分析指标预置在科研平台指标库中,预置的专病指标包括临床表现、并发症、并
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发感染指标、护理出入量、检验结
01|=eFn二iE:’
果、用药指标药品、护理指标、检查
报告关键性描述(如肺实变)、细菌/病毒鉴定培养、药敏结果等。
专病数据集市层是依据专病指标库的条件,从临床数据中心中抽取所需数据,将数据存储于专病数据集市中,用以对专病进行各类科研分析。专病数据集市的数据比临床数据中心目标性更强,在分析、内容、表现以及易用方面迎合了科研用户的特殊需求。当前医院科研平台已预置呼吸科的专病科研数据集市。
应用层以专病数据集市层的数据为素材,实现科研应用。是根据用户的科研需求,量身定制的科研应用模块。应用层是科研平台的数据结果展示层及统计分析层,提供预置的科研应用模块,包括病历检索系统、专科视图、科研患者数据分组和科研随访等应用。同时平台提供R统计软件的运行环境,提供基于此类统计软件的科研应用,使科研人员可基于R等统计软件进行高端的、个性化的科研统计分析应用,以满足用户多样化的科研需求。
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据中心,可按照单个或多个组合条件从专病数据集市层中搜索符合指标的病例。检索结果包含门诊诊断、住院诊断、检查明细、检查结果、检验明细、检验结果等信息。
3.2专病诊断视图专病诊断视图的开发借鉴了患者可视化索引系统的开发思路¨1,是针对专一病种的治疗监控视图,展现该专科病例从首诊到出院整个过程中产生的所有诊疗数据。以时间轴和诊疗信息类型的展现维度,全面、准确地展现病例在诊疗过程中产生的信息。专科视图是临床统一视图更精细化的应用,针对专科的科研病例,深入展现诊疗信息中有科研价值的部分。图2是医院呼吸科专病视图,记录了时间轴上患者体温、用药、检验指标的数值,监控患者在不同用药时点对应的生命指针。
3.3科研数据管理系统科研数据管理系统是医院科研平台的系统管理模块,可实现对科研的自由化配置,主要功能是对专病指标库的维护。科研平台虽然预置了大量指标库,可以满
纳入需要服从医学研究设计,故需要符合特定的纳入;隹则。科研数据管理平台提供了样本及指标的纳入模板。3.4科研随访科研随访是针对科研病例的随访。病人离院后的后期康复情况跟踪需要科研随访系统的支撑。科研随访主要业务包括针对单个病例的科研随访记录,和针对多个病例的科研随访统计分析。随访系统内置标准的电子化随访记录单,科研人员可将随访内容录入,实现数字化归档和整理。开展科研随访业务时,可查看病人在院内的诊疗信息,对随访进行支持。为使医护人员和随访病例更流畅的沟通,提高科研随访工作效率,科研随访还支持App和微信应用,通过App&P时上传自身随访情况,科研系统会自动生成随访结果单。
3.5统计分析科研平台提供了预置统计模型和自定义导出两种形式的统计支持。科研平台与R统计软件进行对接,预设常用的医学科研统计模型,实现基于R统计结果输出。当预设的医学科研统计模型中没有工作人员所需内容时,可自定义查询和输出数据,将科研数据导出至IJSPSS等第三方专业分析软件进行分析。
(下转第63页)
3建设成果
3.1科研病历检索系统科研病历检索系统改变了以往从不同业务系统检索科研病例的方法,该系统基于临床数
足医院日常科研需求,但还要全面满足医院的个性化要求。
确定研究总体及样本、拟定观察指标是医学研究的基本工作。研究样本的
《中国数字医学》2016if-P:1
1卷第9期・17
万方数据
进行了改造,当患者出示腕带或条码时系统就能判断患者是否是急诊科的患者,并判断其是否属于新模式。
4应用前景
利用银行卡预授权实现急诊患者预交金模式是医院管理理念及管理思路的仓『j新,这种模式降低了医院的制卡成本,规避了现有预交金模式财务管理存在的风险,减少了患者往返缴费的次数,改善了患者的就医体验,特别是方便了持社保卡就医的医保患者,减少了退费操作次数。新模式启用后,发现几个问题,一是不是所有
(上接第17页)
4讨论
基于大数据科研平台的临床科研分析在医院呼吸科得到很好的应用。一方面科研平台便利了病种数据收集与多维度筛选。医院科研平台汇聚了大量的科研病种病例数及检索条件数,如筛选采集出院诊断中包含“肺炎”的住院病人医嘱相关记录。病种数据库为临床科研人员研究疾病分类、各种病人生存率、肿瘤诊疗效果、新的诊疗方法评估等科研项目的课题筛选和结果分析提供了患者资料和数据的多维度筛选。另一方面,医院科研数据CRF表单完全由科研平台生成,表单生成后可直接生成基于R的统计分析报告,不仅节约了医院科研人员数据处理的时间,也为科研统计分析提供了参考。
基于医院科研平台的临床科研分
析为医院所属各科室提供以病人为中
心的详细临床科研数据,对医院各系统间的临床数据进行标准化整合,能够实现HIS、RIS、LIS等医疗信息系统间的各类科研数据共享,解决了医院
万方数据
银行的借记卡均支持预授权功能,由模式的探讨U】.中国数字医学,2009,4(9):37—
于各商业银行内部处理上的不一致,38.
可能造成银联接口提示预授权成功的【3】刘剑锋,李景波,汪鹏.基-I-{B-医卡的门问题。二是未确认的预授权在30天后
诊支付应用分析与设计【J】.中国数字医将自动撤销,医院需要确保患者没结学,2015,10(3):8-10.
账后的30天内,手工处理预授权信【4】生本有,于爱平,王玮,等.医院”一卡通”系息。在应用的过程中不断地发现和解统应用及效果U】.中国数字医学,2010,5(6):
决问题,以保证此模式可以在门诊流
77-79
程中使用。9
【5】朱刘松,孙颖.基于门诊”一卡通”系统
/参考文献
的医生工作詹信息集成【J】.中国数字医[1】陈丽,杨雅各门诊”银医一卡通”项目的设
学,2014,9(2):61—63
计与应用U】.中国数字医学,2009,4(2):70—72.【收稿日期:2016—03—15】
【2】张志强,茹文龙.医院信息系统门诊预交金
(责任编辑:肖婧婧)
科研人员对数据处理的难题。9
(上接第29页)例的角度,验证了通过互联网来监测、干预、规范患者居
/参考文献
家日常行为管理的有效性。医生和患【1】朱立峰,左铭,万歆,等.医院临床研究中者应用系统的实现和运行,极大促进的大数据应用需求与策略U].中国数字医了医患之间的交流,使得糖尿病患者学,2015,10(12):14—15.
不用每次去社区医院进行血糖监测,[2】王波龙,李志光,张雪静,等.大型综合
充分验证了糖尿病“五架马车”精细性医院科研平台发展现状分析U】.中国医化管理的思想,让糖尿病患者在自我院,2014,18(5):50—52.
管理与医生干预相互协作的基础上,【3】刘保延,周雪忠,李平,等.个体诊疗临床科将血糖的控制达到合理健康的目标范
研信息一体化平台[A】.中国中医科学院首席
围内。9
研究员学术论文集萃,2012.
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尿病综合管理平台的开发与实现U].糖尿病建健康档案信息模型【J].数字技术与应
新世界,2015,12:86—87.
用.2010(5):4—7.
【4】Java百度百科.http://baike.baidu.
【7】郑威琳,张建国.病人可视化索引系统的设
com/subview/29/12654100.htm#view
计与实现们.中国数字医学,2013,8(5):76—78.
PageContent.
【收稿日期:2016—07—12】【收稿日期:2016—04—07】【修回日期:2016—08—05】
【修回日期:2016—08—08】
(责任编辑:赵士洁)
(责任编辑:赵士洁)
t中国数字医学≯2016每第1
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