2011年中国医学院校及附属医院排行榜（前五十强）
中国医学科学院医学高等院校评价课题组认为凡是涌现出能比较持续地反映医学办学水平和医药科研水平的高等级质量指标都将成为我们评价医学院校的依据。2011年，在保持评价体系大框架不变的情况下，课题组适时新增加了一些评价指标，期望能更好地反映出我国医学高等院校的实际状况，特别是更好地反映不同层次医学院、不同类型医学院、不同结构医学院、不同地区医学院的实际情况。2011年中国医学院校及附属医院排行榜（前五十强）评价指标的主要变化情况是，在科学研究及医疗一级评价指标下新增了国家医疗辅助和生命科学实验室等指标。
根据国家重点学科及实验室、省部级重点学科及实验室、博士点、院士、长江学者、国家杰青、国家人才计划、论文数量、博导数量、附属医院实力综合评价）（括号里为带动本所医学院校发展的最好的几所附属医院）
1.北京大学医学部（第一医院、人民医院、第三医院、积水潭医院）
2.清华大学北京协和医学院（北京协和医院、阜外心血管病医院、肿瘤医院）
3.复旦大学上海医学院（中山医院、妇产科医院、华山医院）
4.中山大学中山医学院（中山一院、中山二院、肿瘤医院）
5.上海交通大学医学院（瑞金医院、仁济医院、新华医院、上海九院）
6.第四军医大学（唐都医院、西京医院、口腔医院）
7.浙江大学医学院（浙医一院、浙医二院、邵逸夫医院）
8.第二军医大学（长征医院、长海医院、东方肝胆医院）
9.第三军医大学（西南医院、大坪医院）
10.华中科技大学同济医学院（同济医院、武汉协和医院、梨园医院）
11.四川大学华西医学中心（华西医院、华西口腔医院）
12.中南大学湘雅医学院（湘雅一院、湘雅二院）
13.北京中医药大学（东直门医院、护国寺中医医院）
14.南方医科大学（南方医院、珠江医院）
15.首都医科大学（同仁医院、宣武医院、安贞医院、佑安医院）
16.中国医科大学（中国医大一院、盛京医院）
17.吉林大学白求恩医学部（第一医院、第二医院、中日联谊医院二部）
18.山东大学医学院（齐鲁医院、山大二院、省立医院）
19.哈尔滨医科大学（附属一院、二院、肿瘤医院）
20.广州中医药大学（第一附属医院、第二附属医院）
21.西安交通大学医学院（第一医院、第二医院、中日联谊医院）
22.重庆医科大学（第一医院、第二医院、儿童医院）
23.天津医科大学（总医院、医大二附属医院、肿瘤医院）
24.武汉大学医学院（湖北省人民医院、中南医院）
25.上海中医药大学（曙光医
院、龙华医院、中医医院）
26.南京大学医学院（鼓楼医院、南京军区总医院）
27.南京医科大学（第一附属、第二附属医院）
28.汕头大学医学院（第一附属、第二附属，附属肿瘤医院）
29.山东中医药大学（第一附属、第二附属医院）
30青岛大学医学院（青岛大学医疗集团）
31.河北医科大学（附属第一医院、第二医院）
32.郑州大学医学院（第一附属医院、第二附属医院、河南省肿瘤医院）
33.苏州大学医学院（附属第一医院）
34.安徽医科大学（第一附属医院、附属省立医院）
35.福建医科大学（附属第一医院、附属第二医院、附属协和医院 ）
36.广西医科大学（附属第一医院、肿瘤医院）
37.温州医学院（附属第一医院、第二医院）
38.南京中医药大学（江苏省中医院、第二附属医院）
39.山西医科大学（附属第一医院、第二医院）
40.新疆医科大学（第一附属医院、第二附属医院）
41.兰州大学医学院（第一附属医院、第二附属医院）
42.大连医科大学（附属第一医院、第二医院）
43.暨南大学医学院（广州华侨医院、珠海市人民医院）
44.东南大学医学院（中大医院）
45.南昌大学医学院（第一附属医院、第二附属医院）
46.同济大学医学院（上海十院、同济医院）
47.新乡医学院（新乡医学院第一附属医院）
48.广州医学院（第一附属医院、第二附属医院）
49.广东医学院（广东医学院附属医院）
50.昆明医学院（第一附属医院、第二附属医院）