顺治皇帝的去向是清朝十大奇案之一，到现在仍然是个迷，关于他的结果有多种说法，目前占主流的有三种。
第一种说法在我国民间广为流传。说顺治皇帝是一个爱美人不爱江山的皇帝，出家五台山，最后老死在五台山。顺治十七年（1660年）八月十九日，22岁的董鄂妃因承受不住失去幼子之痛，在承乾宫病死。董鄂妃死后，多情的顺治帝痛不欲生，看破红尘，毅然去了五台山出家，这些情节在民间传说，小说及戏剧中被广泛采用，但可信度不高。
第二种说法是多数人及史学家比较认同的观点，顺治皇帝并没有出家，而是得了天花不治身亡。这一点在《清史稿》和《清世祖实录》中均有记载：“丁是夜子时，上崩于养心殿”，这11个字把顺治皇帝死亡的时间、地点，都交代的特别清楚，但唯独没有交代顺治皇帝死亡的原因。这不得不说一下顺治皇帝得的那种病----天花。在清朝那阵子，天花被称为瘟疫，不但传染率极高，而且得了这种病便是九死一生，死去的人满身溃烂，死相异常恐怖。作为堂堂一国之君，朝廷无论是出于维护颜面还是为了立足未稳的大清江山，都不便把这个真相大白于天下。
据当时的礼部侍郎兼翰林院掌院学士王熙在《自撰年谱》中记载，顺治帝病危时，他奉命起草《遗诏》。王熙在这部书中详细讲述了被传旨召入养心殿、聆听完顺治帝旨意后起草诏书、三次进呈让他钦定的全过程。
另外，当时负责给顺治进行佛家火化仪式的溪森和尚（也作茆溪森、行森）死后，他的弟子在整理他的遗作中也发现了相关的记录。溪森在书中清楚地记载：顺治死之前就留下遗嘱，要求自己死后遵照祖制，实行火浴，并指定当时和朝廷关系十分密切的溪森到京城为他火浴。顺治去世后，遗体被移到了景山寿王殿，四月溪森赶到了北京，在景山寿王殿前举行法会，将顺治皇帝火浴（放在柴垛上烧）。这些材料都有力地证明，顺治是病死的，不是出家了。
后来之所以会产生出家这一说，首先是因为顺治本身就信奉佛法；二是顺治在风华正茂的时候突然死去，很可能引起局势动荡，朝廷有意散发出了他出家的消息。再加之后来的文学、戏曲、影视作品的推波助澜，这一说法才得以在民间广泛流传。
第三种说法是最近两年才刚刚提出来的。说顺治皇帝是亲率清军同郑成功的军队作战时，被对方的炮弹击中而死，就是说顺治皇帝成了郑成功的炮灰。
这种观点源于一份新发现的名字叫做《延平王起义实录》的史料，这份史料是从泉州南安的郑成功后人手中得来的。由于手抄本年代久远，文字晦涩难懂，对史事的记载与其他众多史料有很大出入，其可信性尚待考证。
相关内容已画成《漫画中国通史》、由浙江少年儿童出版社出版，当当、京东及新华书店均有售。