常见的脱硫工艺：
1.干法脱硫
沼气从脱硫塔的一端，经过填料层（主要成分是活性炭和氧化铁）净化后，从另一端流出。硫化氢与填料层的氧化铁发生反应，生成硫化铁；待氧化铁反应结束后，可进行再生。
脱硫原理：
Fe2O3 · H2O+ 3H2S = Fe2S3 + 4 H2O
再生原理：
Fe2S3 + 3/2 O2+ 3 H2O = Fe2O3 ·H2O + 2 H2O+ 3 S
2.湿法脱硫
工艺流程图如下：
湿法脱硫是将沼气送入洗涤塔，经碱性溶液洗涤吸收后流出，洗涤液进入富液槽、再生槽，通过使用化学药剂方法催化、氧化，最终将硫化物转化为单质硫（硫泡沫），吸收液可以再生循环使用。
3.生物脱硫
工艺流程示意图如下：
生物脱硫也是湿法脱硫的一种，与上述湿法脱硫的催化氧化工艺相比，最大区别是使用硫杆菌替代化学催化剂，将硫化物直接氧化成硫单质。
反应原理：
H2S + OH-= HS- + H2O
HS- + 1/2O2= So + OH-
三者之间的比较：
说明：
1） 干法脱硫多用于硫化氢处理负荷小，或者对脱硫效果要求很高的工况。这时，干法脱硫多用于湿法脱硫或者生物脱硫之后，进一步脱硫。
2）在制定脱硫效果时，建议根据后续设备（锅炉或发电机）对硫化氢浓度的限制，以及沼气与天然气消耗量的比例，制定一个合理的脱除效果。我们通常建议最终的硫化氢含量控制在25~100ppm。